L'Osservatorio Astrofisico di Asiago ha iniziato la sua attività nel 1942 e da allora ha pubblicato dati e pubblicazioni che vengono custodite presso l’osservatorio. Questo rappresenta un fondo storico di immenso valore che il Museo e il Dipartimento di Fisica e Astronomia in collaborazione con l’Osservatorio Astronomico di Padova conservano e rendono fruibile.

I fondi storici sono così suddivisi:
• archivio fotografico è costituito da circa 78000 lastre, quasi tutte in buono stato di conservazione, ottenute fino al 1997. L'archivio viene mantenuto ad Asiago in una stanza dedicata con condizionamento di temperatura e umidità, assieme al materiale fotografico ottenuto con i telescopi Schmidt da 64/92 cm e Copernico da 182 cm dell'Osservatorio Astronomico di Padova, situati ad Asiago e Cima Ekar.
• Archivio disegni tecnici dell’Osservatorio che comprende oltre 350 tavole grafiche suddivise per tipologia
• Archivio storico dell’Osservatorio che copre gli anni 1929-1950 e composto da 1192 documenti in 2535 pagine
• Archivio tecnico degli strumenti del museo composto da 1048 documenti in 18152 pagine
• Deposito del museo che custodisce gli strumenti non esposti al museo e comprende oltre 200 pezzi.

L’attività del Museo e dell’Osservatorio in generale è quella di conservare questi fondi, ove possibile provvedere al loro restauro, digitalizzazione e fruizione agli studiosi.